La mayoría de los hombres que reciben tratamiento de quimioterapia conservan su capacidad normal de erección, aunque en algunos de ellos sí surgen problemas. La capacidad de erección y el deseo sexual a menudo se reducen justo después de recibir una sesión de quimioterapia, pero se normalizan alrededor de una semana después.

La quimioterapia puede a veces afectar el deseo sexual y la capacidad de erección al desacelerar la producción de testosterona. Algunos de los medicamentos usados para prevenir las náuseas durante la quimioterapia también pueden alterar el equilibrio hormonal en el hombre, pero éstos deberán normalizarse una vez finalizadas las sesiones del tratamiento.

Los hombres que han padecido la enfermedad injerto-contra-huésped luego de un trasplante de médula ósea son más propensos a tener una pérdida a largo plazo de testosterona. En algunos casos, puede que estos hombres requieran de terapia de restitución de testosterona para recuperar su capacidad de erección y deseo sexual.

Algunos medicamentos del tratamiento para cáncer como cisplatino, vincristina, bortezomib y talidomida pueden causar daño permanente a partes del sistema nervioso, por lo general, en los nervios pequeños de las manos y los pies. No hay estudios disponibles en la investigación médica que muestre que estos medicamentos lesionan de forma directa los conjuntos de nervios mayores que permiten la erección, pero algunas personas tienen la inquietud debido a los medicamentos que se sabe que sí afectan los tejidos nerviosos, aunque hay muchos nervios involucrados en la función sexual.

La quimioterapia puede causar también un brote de herpes genital o verrugas genitales en caso de que el hombre ya haya padecido estas condiciones anteriormente. También puede generar infertilidad a corto o a largo plazo (consulte la sección "Fertilidad y tratamiento contra el cáncer").